Организация надежного обмена данными с участием ВИМИС невозможна без формирования и выгрузки структурированных электронных медицинских документов (СЭМД) в формате CDA.
СЭМД содержит ряд обязательных блоков, обеспечивающих его максимальную достоверность и актуальность. К ним относятся, в частности, требования наличия информации о документах пациента, требования идентификации врача, подписавшего результаты, наличие ЭЦП врача и ЛПУ.

Впервые в модуль «Бактериология» ЛИС АКЛ были встроены оперативно обновляемые экспертные правила Европейского комитета по определению чувствительности к противомикробным препаратам (EUCAST).